A Skype mind az egyéni, mind a vállalati felhasználók körében nagyon népszerű alkalmazás. A szoftver azonban egyre több fenyegetettséggel párosul, ugyanis mind több olyan támadási formára derül fény, amelyek az azonnali üzenetküldőkben rejlő lehetőségeket igyekeznek kihasználni. A felhasználók megtévesztésén alapuló károkozások különösen gyakoriak. Ezek során a felhasználó egy üzenetet kap, amelyben egy kártékony weboldalra mutató hivatkozás is megtalálható. Amennyiben erre kattint, akkor azonnal megfertőződhet a számítógépe. Az is előfordulhat, hogy a támadók megszerzik a vírusos PC-ken található címlistákat, és azokra is továbbítják a rosszindulatú üzeneteiket. Ennek hatására az áldozatul esett felhasználó ismerősei sem maradnak ki a támadásból.

A Skype a vállalati környezetekben további problémát is felvet, hiszen nagy az adatszivárgások veszélye. A szoftveren keresztül ugyanis könnyedén lehet kijuttatni bizalmas információkat. Mivel a Skype számos költséghatékony megoldást biztosít az üzleti kommunikációhoz is, ezért általában nem célszerű a letiltása. Azonban az ellenőrzés nélkülözhetetlen. Ebben igyekszik segítséget nyújtani a FaceTime legújabb megoldása.

A FaceTime tavaly mutatta be az első olyan Skype kompatibilis termékét (az Internet Security Edition for Skype-ot), amely a népszerű üzenetküldő felügyeletét és használatának szabályozását hivatott támogatni. A cég legújabb terméke ennél azonban jóval több tartalomszűrési lehetőséggel kecsegtet. A Greynet Enterprise Manager (GEM) eszköz legújabb változata, ugyanis képes a titkosított Skype üzenetekben is kutakodni, és folyamatosan olyan hivatkozásokat keresni, amelyek kártékony weboldalakra mutatnak. Vagyis mostantól az eddig titkosított kommunikáció is ellenőrizhetővé válik. Az új biztonsági megoldás alátámasztotta, hogy a FaceTime és a Skype között régebben létrejött - ez idáig egyedülálló - fejlesztési megállapodás a gyakorlatban is jól működik.